TÉLÉCHARGER PROGRAMME ANAGENE GRATUITEMENT
Il est destiné à l'exploitation pédagogique de données moléculaires : séquences de gènes et de protéines. L'élève peut ainsi travailler sur des gènes et des protéines en taille réelle et non sur des séquences réduites à quelques nucléotides ou acides aminés. Traitements courants Options d'affichage Convertir les séquences Comparer les séquences. Action des enzymes de restriction. Aller plus loin Créer ou supprimer un thème personnel Enrichir la banque de séquences : o A partir de fichiers sélectionnés et compressés.
Nom: | programme anagene gratuitement |
Format: | Fichier D’archive |
Version: | Dernière |
Licence: | Libre (*Pour usage personnel) |
Système d’exploitation: | MacOS. iOS. Windows XP/7/10. Android. |
Taille: | 60.52 MB |
Exercice SVT
En cliquant sur le lien "Fasta" de la séquence choisie, on affiche la séquence recherchée dans la fenêtre du navigateur. Retour Importer les séquences au format mega Un fois la séquences affichée, un clic sur "Add to alignment" transfère la séquence en question dans un nouvel afficheur appelé "Alignment Explorer".
Mega étant un logiciel complet d'affichage, d'alignement et de construction de matrices et d'arbre. Il est possible d'importer ainsi plusieurs séquences mais il est préférable de faire les importations une à une pour simplifier les manipulations ultérieures.
Donner un nom très explicite au fichier qui portera l'extension. La saisie du titre permet de préciser encore. On répond "Yes" à cette question si la séquence est codante.
La totalité de cette démarche sera répétée pour chacune des séquences à importer à partir de NCBI.
Le logiciel Phylogène chez vous !
Comme indiqué plus haut, il est impératif que les séquences soient homologues pour que le travail ait un sens. Retour Constituer et utiliser le fichier au format. On voit ici les trois fichiers après ce changement.
Il faut ensuite ouvrir le logiciel Anagène. La séquence trouvée par le logiciel est détectée comme de l'ADN.
Sciences de la vie et de la Terre
On peut aussi créer ses thèmes personnels 5 Documents illustratifs textes, images, animations Le logiciel présente une série de documents textes, images et vidéo regroupés par thèmes et qui peuvent être affichés avec les séquences. Traitements courants Options d'affichage Sélectionner une séquence Cliquer devant le nom de la séquence pour y amener la flèche rouge de sélection Cliquer alors sur la flèche, le nom de la séquence sélectionnée s'affiche sur fond blanc Changer d'échelle Choisir la taille du curseur échelle graduée en nucléotides échelle graduée en ac.
Sélectionner une zone codon s ou ac. Pour cela cocher la case ci-dessous..
Cocher ici Comparer les séquences. Dans la fenêtre d'affichage, sélectionner les séquences à comparer. On peut recaler les séquences en utilisant le bouton Le nucléotide est rajouté en début de séquence ce qui décale la partie identique!
Ce traitement détermine le résultat de l'action de différentes enzymes de restriction sur des séquences sélectionnées. Ce bouton permet d'afficher le nombre et la taille des fragments de restriction. Deux modes de représentation de l'action enzymatique sont prévus : la visualisation sous la forme d'un tableau si on utilise plusieurs enzymes sur plusieurs séquences ou d'un graphique, les deux modes pouvant être retenus simultanément.
Aller plus loin 11 Créer ou supprimer un thème personnel Créer un thème En plus des thèmes d'étude fournis, il est possible d'en créer de nouveaux adaptés à une stratégie pédagogique personnelle ou à un public déterminé. Un thème d'étude est constitué par l'enregistrement de toutes les fenêtres présentes dans l'espace de travail d'anagène, même si elles sont réduites en icônes : Séquences, images, vidéos Enrichir la banque de documents.